Częstotliwość dezynfekcji stetoskopu zależy od sposobu i środowiska użytkowania:
W zwykłych oddziałach ambulatoryjnych, jeżeli stetoskop jest używany wyłącznie u pacjentów ogólnych i nie ma widocznych zanieczyszczeń, zaleca się jego dezynfekcję 1-2 razy w tygodniu.
Na oddziałach pediatrycznych i pulmonologicznych, na których istnieje ryzyko kontaktu z patogenami zakaźnymi, lub w specjalnych pomieszczeniach, takich jak oddziały zakaźne i oddziały intensywnej terapii, dezynfekcję należy przeprowadzać po każdym użyciu.
Jeżeli stetoskop jest używany przez wielu różnych pacjentów w krótkim odstępie czasu, najlepiej jest go dezynfekować po każdym użyciu, nawet jeżeli odstęp czasu między kolejnymi użyciami jest krótki.
